小止星碰击天球，主要年夜天遭到名为「忍」（シノビ）的迫害，造成同形袭击人类，人们只能遁背之前是海底的「海陆」；拯救的要领惟有新生「机神将」（机神将（ギガロード））。约五百年后，亡国「伊势」的公主巫女雨、与占有世间武器「柳死」（ヤギュウ）之血的少年周防两人自告奋勇……